Os puedo comentar mi caso, tengo tres caballos, los tenia con su cartilla, pero sin chic, hace un mes contacte con un veterinario, y se encarga de todo, reseña el caballo, se lo pone y con el numero de explotación el tramita la documentación oportuna, posteriormente tú recibes toda la documentación por parte de la sección determinada de la comunidad autonoma.
Con eso ya puedes transportar el caballo a cualquier lado, si puede servir de orientación me costo 35€ por caballo. Pero si se que el precio depende un poco de cada veterinario.