Yo esperaría a que estuviese bien cicatrizado y le hubiese salido el pelo (así te aseguras de que la piel no está tan tierna). Las rozaduras del equipo pueden llegar a ser un engorro como no las cojamos a tiempo o no las dejemos curar bien, sobre todo las de la cruz.
Si la herida se la ha hecho por el roce de la silla, puede que con un salvacruces evites los roces "gordos" de las silla. Pero el problema es que, al añadirle grosor, igual creas un punto de presión que le acaba haciendo unas heridas peores. Si la herida se le ha hecho arriba por el borrén delantero, la silla puede que sea demasiado ancha. Si ha sido a los lados, puede que sea demasiado estrecha (creo, igual es al revés y me estoy liando). Puede que incluso tu caballo tenga mucha cruz, algunos necesitan sillas a medida por este motivo.
Por ello, lo primero que haría yo sería mirar si la silla le ajusta bien y, si no lo hace, o hacerte con una que le ajuste o buscar un salvadorsos que compense sus defectos (pero primero hay que identificar cuáles son)